Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP2P63027 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP2P63027 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms