Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms