Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN1P60606 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms