Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms