Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms