Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPOP42166 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPOP42166 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPOP42166 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPOP42166 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPOP42166 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPOP42166 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPOP42166 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPOP42166 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPOP42166 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPOP42166 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPOP42166 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPOP42166 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMPOP42166 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMPOP42166 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMPOP42166 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMPOP42166 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPOP42166 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPOP42166 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPOP42166 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPOP42166 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPOP42166 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPOP42166 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPOP42166 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPOP42166 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPOP42166 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPOP42166 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms