Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms