Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMI1P35226 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMI1P35226 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMI1P35226 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMI1P35226 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMI1P35226 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMI1P35226 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMI1P35226 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMI1P35226 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMI1P35226 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMI1P35226 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMI1P35226 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMI1P35226 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMI1P35226 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMI1P35226 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMI1P35226 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMI1P35226 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMI1P35226 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMI1P35226 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMI1P35226 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMI1P35226 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMI1P35226 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms