Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms