Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC27P30260 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC27P30260 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC27P30260 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC27P30260 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC27P30260 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC27P30260 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC27P30260 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC27P30260 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC27P30260 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC27P30260 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC27P30260 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC27P30260 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC27P30260 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC27P30260 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms