Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms