Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms