Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNT1P13805 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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