Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms