Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C4BP0C0L5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
C4BP0C0L5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C4BP0C0L5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C4BP0C0L5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C4BP0C0L5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C4BP0C0L5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms