Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms