Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR1AO95602 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR1AO95602 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms