Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UFL1O94874 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFL1O94874 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFL1O94874 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFL1O94874 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFL1O94874 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFL1O94874 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFL1O94874 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFL1O94874 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFL1O94874 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFL1O94874 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UFL1O94874 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFL1O94874 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFL1O94874 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFL1O94874 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFL1O94874 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFL1O94874 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFL1O94874 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFL1O94874 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UFL1O94874 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFL1O94874 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFL1O94874 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFL1O94874 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFL1O94874 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFL1O94874 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFL1O94874 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UFL1O94874 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFL1O94874 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFL1O94874 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFL1O94874 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFL1O94874 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 375.1 ms