Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDKL5O76039 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms