Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms