Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDIL3O43854 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms