Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALUO43852 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALUO43852 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CALUO43852 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALUO43852 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALUO43852 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALUO43852 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALUO43852 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALUO43852 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALUO43852 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALUO43852 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms