Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNAB3O43448 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms