Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBFA2T2O43439 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms