Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms