Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
J3KT08 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
J3KT08 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
J3KT08 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
J3KT08 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms