Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms