Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IGKV2-40A0A087WW87 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms