Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MTIF3-202ENST00000381120 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TRBV5-3-201ENST00000390362 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL451048.1-201ENST00000413328 217 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL445524.1-205ENST00000425412 392 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC007000.1-201ENST00000453064 794 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPS6P25-201ENST00000464444 748 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SSU72P8-201ENST00000473520 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC018816.1-206ENST00000474544 455 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC116353.1-201ENST00000489727 316 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC084871.2-201ENST00000503355 464 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL358332.1-201ENST00000555649 813 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL121820.1-201ENST00000556919 461 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC092133.1-201ENST00000565828 719 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TMEM144-201ENST00000296529 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 GPNMB-202ENST00000381990 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SH3D19-202ENST00000409252 4888 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ZNF35-202ENST00000396056 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CUBNP1-201ENST00000412710 1790 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ZNF512-208ENST00000556601 3543 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 FBXL17-206ENST00000619412 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CDKL5-202ENST00000379996 3449 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC020549.1-201ENST00000536916 1440 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LCLAT1-201ENST00000309052 5060 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ASAH1-203ENST00000381733 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CELF2-212ENST00000632728 3827 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC008522.1-201ENST00000639479 2906 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CERS6-AS1-201ENST00000425636 2890 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 DPH3-202ENST00000383775 3052 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OR51M1-201ENST00000328611 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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