Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RUNX1T1-252ENST00000617740 7627 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL353795.3-201ENST00000624351 5702 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MYOM1-201ENST00000261606 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL031595.3-201ENST00000624919 14262 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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BPTFQ12830 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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BPTFQ12830 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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BPTFQ12830 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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BPTFQ12830 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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BPTFQ12830 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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BPTFQ12830 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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BPTFQ12830 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 C1QTNF7-204ENST00000429690 4464 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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