Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC090358.1-201ENST00000579862 852 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC073218.2-201ENST00000606468 295 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC073869.3-201ENST00000609270 580 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RN7SL796P-201ENST00000613991 291 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC009053.4-201ENST00000614366 108 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AL118508.2-201ENST00000622708 673 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 ALG13-226ENST00000622986 582 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 snoMe28S-Am2634.2-201ENST00000637869 80 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 SERPINB2-201ENST00000299502 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 MITF-202ENST00000314589 1993 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 ZNF160-214ENST00000601421 4688 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 NCAM1-222ENST00000615285 6045 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 LIMCH1-215ENST00000512632 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 ARID4A-201ENST00000348476 5562 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 LINC00494-201ENST00000416742 3544 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 NR1I2-203ENST00000466380 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 SEZ6L2-201ENST00000308713 3801 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 MAPK10-233ENST00000515650 2394 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 ZNF665-201ENST00000396424 4159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 OR2A4-201ENST00000315453 1758 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 DGKB-206ENST00000407950 3651 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 IL17A-201ENST00000340057 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 ZNF347-207ENST00000601469 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 ELOC-202ENST00000518127 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 OXNAD1-207ENST00000606098 2288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC016205.1-201ENST00000591629 2306 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 MAPK10-279ENST00000641157 2449 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RBM17-205ENST00000446108 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RARRES3-201ENST00000255688 749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 PHKA2-AS1-201ENST00000439295 597 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RN7SL77P-201ENST00000473332 294 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC138866.1-201ENST00000514522 497 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RNA5SP460-201ENST00000516789 100 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 SCARNA20.3-201ENST00000516913 131 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC136424.1-201ENST00000518425 542 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 ACTBP6-201ENST00000520036 1090 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 FDPSP4-201ENST00000534629 1049 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AL359792.1-201ENST00000554046 385 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 LINGO1-AS1-202ENST00000558887 1124 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC126323.1-201ENST00000561706 611 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RN7SL118P-201ENST00000580570 302 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 ESR1-206ENST00000427531 5436 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 NTRK3-221ENST00000629765 2714 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 SOCS4-204ENST00000555846 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CAMK2BQ13554 ADGRD1-205ENST00000535015 2776 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms