Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC024267.6-202ENST00000579187 1103 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC005758.1-201ENST00000586408 625 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 LINC01531-206ENST00000602653 892 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 NELFE-214ENST00000625905 111 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 DCLRE1C-206ENST00000378254 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 GALNT14-203ENST00000406653 2496 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 ITSN1-211ENST00000399355 4003 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 MPP2-218ENST00000536246 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 COL11A1-202ENST00000358392 7327 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC026369.1-202ENST00000508953 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 ZNF180-211ENST00000592529 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 SMS-202ENST00000404933 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC116913.1-201ENST00000565387 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 FLII-222ENST00000579294 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AP000708.1-201ENST00000527818 3423 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 SOX5-212ENST00000541536 2365 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 STXBP5-AS1-209ENST00000606831 2025 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 PDLIM5-206ENST00000437932 5713 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 CICP22-201ENST00000432801 1319 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 LINC02245-201ENST00000449259 2928 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 LINC00909-202ENST00000580048 3463 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 GBAP1-201ENST00000368374 1873 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 TG-208ENST00000519543 3132 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 ATP8A1-201ENST00000264449 8209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 CCDC112-206ENST00000512261 2279 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 BNC2-202ENST00000380667 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 MAP3K13-209ENST00000443863 3025 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 CPEB1-208ENST00000611163 1919 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 AC027801.1-201ENST00000376609 2100 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 SDE2-201ENST00000272091 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HOXD11P31277 HHAT-208ENST00000545154 3507 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 NBPF12-201ENST00000439206 1831 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 NBPF26-203ENST00000611702 1831 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 NBPF14-204ENST00000611826 1831 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 FHOD3-202ENST00000359247 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 BAHD1-201ENST00000416165 4526 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MIR4435-2HG-202ENST00000371162 2044 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PASK-215ENST00000544142 4724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 HOXA-AS3-202ENST00000518947 3992 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 STXBP1-218ENST00000637173 4193 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC00265-201ENST00000340510 3049 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RBM44-202ENST00000409864 3449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 IL37-203ENST00000349806 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 C5orf52-201ENST00000409999 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 Z97987.1-202ENST00000411708 391 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC145543.1-201ENST00000424770 586 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MIR205HG-204ENST00000431096 908 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC091132.2-201ENST00000433601 769 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RN7SL337P-201ENST00000462468 301 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 GCNT1P2-201ENST00000504682 595 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 IGLVI-70-201ENST00000523272 390 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LYNX1-207ENST00000523332 600 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MKNK2-211ENST00000591142 875 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AP005131.6-201ENST00000587344 4215 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC01142-201ENST00000440404 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 NCOA4P4-201ENST00000513338 1861 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC091198.1-201ENST00000591558 2492 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ZBED9-201ENST00000452236 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 NXF1-211ENST00000531709 4128 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SAXO1-203ENST00000542071 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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