Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms