Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms