Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LDB3-201ENST00000263066 3873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TMCC3-203ENST00000551457 4361 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC090983.1-201ENST00000623426 3897 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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