Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 OGFOD1P1-201ENST00000447552 1592 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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GRIK4Q16099 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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GRIK4Q16099 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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GRIK4Q16099 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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GRIK4Q16099 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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