Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 PITRM1-AS1-201ENST00000430356 3998 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 GABPB1-205ENST00000429662 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 VTRNA1-2-201ENST00000365241 89 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 SUN5-203ENST00000375523 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 MORF4L1P1-201ENST00000404582 967 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC015977.2-201ENST00000420852 567 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TTC28-AS1-216ENST00000437713 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ABCA9-AS1-201ENST00000458677 523 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC124067.1-201ENST00000517897 169 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC110741.1-201ENST00000520149 582 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TMEM132D-AS1-204ENST00000537367 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC073913.2-201ENST00000541512 145 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC138123.3-201ENST00000551928 791 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RN7SL14P-201ENST00000579715 298 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 CD300LF-208ENST00000581500 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RN7SL82P-201ENST00000611435 237 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC087742.2-201ENST00000616113 740 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RN7SL628P-201ENST00000619139 237 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TRIM37-214ENST00000625984 204 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TAGAP-203ENST00000367066 3887 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RPL12P38-202ENST00000588627 2319 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 WDR11-AS1-203ENST00000598981 2242 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 GLRA3-202ENST00000340217 3065 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RABGEF1-203ENST00000439720 3065 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL591543.1-202ENST00000642095 4149 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 OPTN-202ENST00000378747 3400 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 HSD11B1-202ENST00000367027 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 MAN1A2P1-201ENST00000590286 1400 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RXFP1-207ENST00000470033 2175 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 GBA3-203ENST00000508166 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 MATN2-208ENST00000520016 3495 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 HERC3-201ENST00000264345 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 MTRR-201ENST00000264668 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 CEACAM8-201ENST00000244336 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 MARK3-203ENST00000335102 2331 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL031676.1-201ENST00000412519 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 NLRP3-203ENST00000366496 3996 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ZNF92-202ENST00000357512 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 BTN2A1-203ENST00000429381 3113 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ZNF559-211ENST00000592504 1398 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 UVRAG-208ENST00000532130 1831 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TREM1-202ENST00000334475 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RPS7-204ENST00000407445 833 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 OR2L6P-201ENST00000416377 940 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms