Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CENPFP49454 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CENPFP49454 HIVEP3-201ENST00000372583 12193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CENPFP49454 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CENPFP49454 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CENPFP49454 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CENPFP49454 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CENPFP49454 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CENPFP49454 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CENPFP49454 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CENPFP49454 MUC3A-201ENST00000379458 11226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CENPFP49454 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 PKD1L3-201ENST00000620267 5199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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