Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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