Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NR1I3-235ENST00000628566 1201 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 BRCC3-210ENST00000630295 954 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC007221.2-201ENST00000634367 948 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01359-205ENST00000634604 1050 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC83-202ENST00000342404 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RUNX1T1-248ENST00000613302 7687 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 IKZF3-207ENST00000377944 1669 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TRHR-202ENST00000518632 1660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RAB13-205ENST00000614713 1353 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01747-203ENST00000634603 1377 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF562-208ENST00000590155 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MS4A6A-208ENST00000528851 1806 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 BCL9P1-201ENST00000506012 2561 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CDYLP1-201ENST00000419017 1458 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms