Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NCOA4Q13772 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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NCOA4Q13772 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NCOA4Q13772 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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