Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GY05 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GY05 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GY05 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GY05 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GY05 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GY05 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GY05 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GY05 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
V9GY05 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
V9GY05 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
V9GY05 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GY05 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GY05 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms