Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HPSEQ9Y251 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPSEQ9Y251 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms