Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms