Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms