Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms