Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TLR7Q9NYK1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms