Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALKBH4Q9NXW9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms