Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RTN4Q9NQC3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4Q9NQC3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms