Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GPCPD1Q9NPB8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPCPD1Q9NPB8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms